Les documents disponibles en ligne

À la suite des constatations effectuées ces dix dernières années concernant l’appauvrissement de la flore aquatique des lacs jurassiens, des investigations précises ont été conduites par le Conservatoire Botanique National de Franche-Comté. Au cours de la période 2005 - 2007, une dizaine de lacs a été étudié, à savoir : - le Petit et le Grand lacs de Clairvaux (Jura) ; - le lac du Fioget (Jura) ; - le lac du Vernois (Jura) ; - le lac de Malpas (Doubs) ; - le lac de Saint-Point (Doubs) ; - le lac de Remoray (Doubs) ; - les lacs de Bellefontaine et des Mortes (Jura et Doubs) ; - le lac des Rousses (Jura). Ces bilans publiés dans une synthèse (Guyonneau J. et al., 2007) sont essentiellement basés sur l’établissement de typologie et la réalisation de cartographie de la végétation et de la flore.
Il convenait d’étendre ce type d’investigation et la même méthodologie à d’autres lacs, et notamment à ceux dont l’intérêt floristique et la complexité de la végétation étaient connus pour être remarquables et en même temps exposés à des risques de dégradation. Par ailleurs, le Parc naturel régional souhaitait, dans le cadre de l’appel à projets « érosions, zones humides et aires de captages » lancé par le Ministère de l’écologie et du développement durable, disposer d’éléments sur la qualité écologique du lac de l’Abbaye et sur son évolution, ce pour quoi il a été décidé de l’étudier.

La liste des associations et des groupements végétaux retenus dans ce synopsis est basée sur des mentions explicites de leur présence dans la dition dans la littérature, y compris des rapports d’études récents. Un certain nombre d’unités a également été retenu sur la présomption de leur présence en Franche-Comté sur la base d’un avis d’expert ou de leur présence dans des régions adjacentes dans des conditions écologiques existantes en Franche-Comté.
Les unités retenues sont déclinées au niveau de l’association ou d’unités de rang équivalent dénommées « groupement à » pour les communautés végétales n’ayant pas encore fait l’objet d’une description phytosociologique.
Les éventuelles sous-unités (sous-associations essentiellement) reconnues dans la dition sont indiquées.
Ces unités élémentaires sont organisées et classées dans un système phytosociologique sigmatiste. Les positions synsytématiques et synomenclaturales adoptées sont basées sur celles proposées par BARDAT et al. (2004) et par ROYER et al. (2006).

Cette étude s’inscrit dans le programme d’amélioration de la connaissance et d’évaluation des habitats du Conservatoire botanique national de Franche- Comté.
Ce programme répond à la nécessité d’évaluer régulièrement, dans le cadre de la Directive Habitats- Faune-Flore, l’état de conservation des groupements végétaux, tant au sein du réseau Natura 2000 qu’en dehors. Pour cela, ce guide préconise deux axes d’étude. D’une part, il s’agit de procéder à un recensement général des groupements végétaux de la région, afin de mieux connaître leur distribution et leur rareté en Franche-Comté. D’autre part, il convient d’évaluer, grâce à une méthode originale d’inventaire quantitatif, les surfaces occupées par ces groupements végétaux en tenant compte de leurs états de conservation.
Ce document s’articule principalement autour de la typologie des habitats recensés sur le plateau de Nozeroy ; leur description est établie sur une base phytosociologique sigmatiste, la précision recherchée étant du niveau de l’association végétale. Cet inventaire typologique est complété d’un travail d’inventaire quantitatif des habitats de la sous-unité paysagère et d’évaluation des atteintes et de l’état de conservation des groupements. En annexes sont également présentés les secteurs remarquables d’un point de vue botanique et phytosociologique et qui ne figureraient pas encore à l’inventaire des ZNIEFF de Franche-Comté, ainsi que la liste de l’ensemble des taxons observés sur le plateau de Nozeroy.

La cartographie de la végétation est le préalable indispensable à l’établissement de documents techniques d’aide à la gestion des milieux naturels, tels que les documents d’objectifs des sites Natura 2000 et les plans de gestion des réserves naturelles. Avec l’avènement de nouveaux outils (systèmes d’informations géographiques, orthophotoplans, GPS …), elle est devenue beaucoup plus fiable, mais seule l’adoption de méthodes et de référentiels communs permet aux professionnels d’en faire l’usage le mieux adapté et aux commanditaires de disposer de données comparables.
Les annexes informatiques sont dans un deuxième fichier à télécharger.

Les activités d'eaux vives, et notamment le canoë-kayak, sont des loisirs faisant partie intégrante de l'activité socio-économique de la vallée de la Loue depuis de nombreuses années.
Ces activités pourraient cependant endommager des habitats d'intéret communautaire de grand intérêt pour les bryophytes en particulier.
Les objectifs de cette étude sont de définir les dégradations occasionnées par ces activités sur les communautés végétales bryophytiques du lit mineur de la Loue, de préciser leur impact et d'établir un modèle de répartition des groupements de bryophytes dans le lit mineur de la Loue entre Mouthier-Hautepierre et Chenecey-Buillon.

Cette expertise propose une caractérisation et une typologie des formations tufeuses et des habitats amphibies et aquatiques se développant sur un site Natura 2000, dans le Dard et dans les deux Seille d'amont (Seille de Baumes-les-Messieurs, Seille de Ladoye).