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Le recensement des habitats du site « Vallées du Dessoubre, de la Réverotte et du Doubs », proposé comme Site d’Intérêt Communautaire à la Commission européenne a permis d’élaborer un synopsis comportant 83 unités phytosociologiques du niveau de l’association. Parmi celles-ci, on compte 8 associations de pelouses, 11 groupements prairiaux et une vingtaine de groupements forestiers.
Cette typologie a été mise en oeuvre à l’occasion de deux cartographies-test, l’une portant sur près de 1 500 hectares d’habitats herbacés de la vallée du Dessoubre, entre Consolation-Maisonnettes et Saint-Hippolyte, l’autre sur les 150 hectares du bois du Tremblot, à l’extrême est du site Natura 2000.

Cette étude, réalisée pour le compte de la Direction régionale de l’Environnement de Franche-Comté (DIREN FC) et du Conseil général de Haute-Saône, s’inscrit dans le programme d’amélioration de la connaissance et d’évaluation des habitats du Conservatoire botanique national de Franche- Comté. Les objectifs de ce programme et les moyens permettant de le mettre en oeuvre ont été définis dans un guide méthodologique (Vuillemenot, Fernez et Bailly, 2008).
Ce programme répond à la nécessité d’évaluer régulièrement, notamment dans le cadre de la Directive Habitats-Faune-Flore, l’état de conservation des groupements végétaux, tant au sein du réseau Natura 2000 qu’en dehors. Pour cela, ce guide préconise deux axes. D’une part, il s’agit de procéder à un recensement général des groupements végétaux de la région, afin de mieux connaître leur distribution et leur rareté en Franche- Comté. D’autre part, il convient d’évaluer, grâce à une méthode originale d’inventaire quantitatif, les surfaces occupées par ces groupements végétaux en tenant compte de leurs états de conservation.

Cette étude a pour objectif d’établir la cartographie et la typologie des habitats du site « Espace Naturel Sensible » (ENS) « Lac et marais de l’Entonnoir » (communes de Bouverans et de Bonnevaux).
Cette étude doit permettre de fournir les éléments essentiels en vue de la prochaine rédaction du plan de gestion du site par la Communauté de communes Frasne-Drugeon.
La démarche a consisté à réaliser la typologie et la cartographie des milieux terrestres et aquatiques, ainsi que l’inventaire et la cartographie des espèces végétales patrimoniales du site ENS « Lac et marais de l’Entonnoir ». La qualification de l’intérêt des habitats, le recensement des pratiques de gestion, les atteintes aux groupements végétaux d’intérêt, l’analyse de leur état de conservation et de leur évolution par rapport aux données cartographiques antérieures ont été réalisés d’après le cahier des charges régional relatif à la cartographie des habitats (Guyonneau, 2004a).
Ce diagnostic a ensuite donné lieu à la formulation de préconisations de gestion, en fonction des différentes observations notées sur le terrain.

Fiche synthétique présentant les traits distinctifs (et confusion possible), les stratégies de propagation, les nuisances induites, l'origine, l'historique, la répartition en Franche-Comté au printemps 2008, les milieux infestés, le plan d’action et les méthodes de lutte contre une espèce invasive : la Rudbeckie laciniée, Rudbeckia laciniata L.

Fiche synthétique présentant les traits distinctifs (et confusion possible), les stratégies de propagation, les nuisances induites, l'origine, l'historique, la répartition en Franche-Comté au printemps 2008, les milieux infestés, le plan d’action et les méthodes de lutte contre un groupe d’ espèces invasives : les cotoneasters asiatiques (Cotoneaster horizontalis Decne - Cotoneaster damneri C. K. Schneid. et C. sp.pl.)

Fiche synthétique présentant les traits distinctifs, la biologie, l’écologie, la répartition et l’état de conservation en Franche-Comté d’une espèce menacée : l'Aspérule des teinturiers (Asperula tinctoria L.). La fiche présente également, la responsabilité de la région dans sa conservation ainsi que le plan d’action et les mesures conservatoire à mettre en place.